黄河流域生态保护和高质量发展的国家战略需要与创新驱动的国家战略的实施有机结合，重构黄河流域各地区高质量发展的驱动体系。黄河流域创新驱动发展的制约因素是，黄河流域的生态环境和水资源状况依然严峻，与东部地区和长江流域的发展相比存在明显差距，以水资源利用为核心的流域经济合作机制尚未形成。创新驱动战略的目标是以科技创新为首要目标，以因地制宜、分类政策的产品创新和产业创新为主要任务，以提高全流域资源配置效率为目标的机制和制度创新为制度保障。黄河流域创新驱动战略的总体思路是加强国家战略科技力量，解决黄河流域高质量发展的创新驱动力。增强企业技术创新能力，使企业成为技术创新的主力军。激发人才的创新活力，为积累国内外优秀人才搭建创新高地。黄河流域生态保护和高品质发展创新驱动战略的路径在于节水产业和新能源技术领域的深入研究和长期布局，依托企业技术创新培育新动能，推动合作发展和黄河全流域的协同创新。